船舶与海洋工程学院以海工装备制造专业集群、港口航道专业集群为主体，设有船舶工程技术、港口与航道工程技术、海洋工程装备技术、建筑工程技术、工程造价、智能焊接技术、城市轨道交通工程技术7个专业。其中，船舶工程技术专业群是江苏省“十二五”重点专业群，船舶工程技术专业是江苏省高校特色专业；港口与航道工程技术专业是江苏省试点高职与普通本科分段培养“3+2”建设专业、是“第二批南通高校校企合作示范基地”建设专业；港口与航道工程技术和海洋工程装备技术两个专业是教育部财政部“高等职业学校提升专业服务产业发展能力”项目建设专业。
学院拥有江苏省船舶工程技术研究开发中心、江苏省船舶与海洋工程实训基地、江苏省航道队伍建设与技术创新服务基地、全国航道培训中心江苏分中心基地、南通市船舶焊接技术培训基地等产教融合平台，在江南造船(集团)有限责任公司、江苏省航道局等多家知名企业建有校外实习就业基地。
学院拥有江苏省高校“涉水工程应用技术科技创新团队”1个、南通市技能名师工作室1个；39名专任教师中有教授3名、副教授12名、博士研究生及博士在读5名；拥有江苏省“青蓝工程”中青年学术带头人和骨干青年教师、江苏交通系统教学名师等。
多年来，航海学院以“立德树人、学生发展”人才质量观为本位，积极实行产教融合的办学模式，先后获得南通市“高校校企合作示范基地”和“南通市职业教育服务地方经济贡献奖”；并获得江苏省教学成果一等奖1项、二等奖2项以及南通市科技进步奖等奖项，学生在“挑战杯”等全国各类创新创业大赛中多次获得省一等奖和国家二等奖等佳绩。学生就业率始终保持在95%以上。
